花椒冬季修剪主要是两个方面：一是调整树体形状；二是调整结果枝。花椒的枝组调整比较复杂，树体花量的调整，花芽质量的识别和花芽的保留都要在冬季修剪时一次性做到位，特别是细枝弱枝，发育不良的花芽，和过多的花芽，都要通过修剪进行调整，适当减少质量不好的花芽，可以促进其余花芽的营养充足，增加产量。
1.修剪时间
花椒冬季修剪一般是落叶后至初春花芽萌发前，注意不能在冰冻严寒天气修剪，否则树体容易受到冻害而干枯死亡。
2.修剪方法
花椒树体不高，分枝能力强，冬季修剪时，需要以防虫防病，采光通风和整形矮化为目的。
3.防病防虫修剪
花椒有特殊的香味，本身具有较强的消毒杀菌和防病防虫能力，一般不容易遭受病虫害的侵袭。但是，天气和人为疏忽或管理不善会导致病虫害的发生，例如常见的根腐病、锈病、蚜虫等。
因此，冬季修剪时要剪去病枝，弱枝、干枯枝，避免开春升温后病虫害滋生。之后再刮除翘皮和病斑，使用适当的消毒防护药。
4.采光通风修剪
花椒树分枝多，修剪去除密生枝、平行枝、交叉枝、内膛枝。修剪后可以让枝叶受光均匀，促进了叶片的光合作用，增强树势。同时达到舒朗通风，趋避虫害的目的。
5.树体整形修剪
整形修剪是指人们对花椒的强旺枝、过长枝、新生枝进行短截、缩短、缓放，达到调整树体结构、平衡树势、矮化树身、美化树冠的目的。
花椒因为是小乔木，树矮茎枝多刺。因此，修剪时通常会以保留3-4根主枝的方式修剪或拉枝塑性，让树体呈现开心形生长并培养枝组群。这样既可以达到采光通风的目的，又有利于光合作用促进丰产，保证了果实生长品质，还便于采摘。
① 疏枝：一般从根部去掉过长枝、过密枝、平行枝、交叉枝、病虫枝（病枝剪下后到远处处理掉，避免感染正常植株）。
② 短截：剪去一年生枝条的一部分。减去三分之一为轻短截，减去二分之一为中短截，减去三分之二为重短截，剪留一个小桩为极重短截。决定短轻重是依树体的生长发育状况而定，生长较弱的重短截，生长较强的要轻短截。
③ 回缩：剪去多年生枝条的一部分，一般对下垂直、过长枝、病虫枝、交叉枝、衰老枝会用回缩的方法。
④ 缓放：对位适当的枝条不管不截，让自然生长。
⑤ 拉枝：对直立的树枝，位置适度采取拉、压、拽、支、撑的办法，让张开角度，以促进萌发结果枝。
⑥ 拿枝：对角度较直，不好拉开的枝条，用手将他扭曲，让木质变软，然后培养成结果枝。
⑦ 摘心：位置生长合适的，可以做为结果枝，进行摘心处理，让发育成结果枝。
⑧ 抹芽：对于发芽过密的枝芽，选择适当的保留，位置不好的及早抹去，省的后面修剪。