骨干枝的修剪
根据自然开心形的树体结构，结果期虽然主、侧枝头一般不再增加，但需要继续加强培养，使其形成良好的树体骨架。对长势强的主枝，可适当疏除部分强枝，多缓放，轻短截；对弱主枝，可用疏枝，多短截。
对背上枝如放任不加控制时，过几年该枝就会超过原主枝，背上枝的后部侧枝枯死，造成结果部位外移，所以应及早控制背上枝生长，削弱生长势，以利结果。对生长较弱背上枝应短截，复壮更新。
对背上枝、下垂枝总的原则是尽量利用，注意观察，灵活采取措施，以扩大树冠为目的，多结果为准则。
对徒长枝，在幼树整形期间，要控制其生长。控制的办法有重短截、摘心等。在结果期，可把徒长枝适当培养成结果枝组，补充空间，增大结果面积。
对生长旺盛的直立徒长枝，一定要在夏季摘心，或冬季在春秋稍分解处短截，促生分枝，削弱生长势。当徒长枝改成结果枝组后，若顶端的变弱，后部光秃，又无生长空间时，应及时重短截。
辅养枝的利用和调整
在主枝上，未被选为侧枝的大枝，可按辅养枝培养、利用和控制。在结果初期，辅养枝既可以增加枝叶量，积累养分，圆满树冠，又可增加产量，所以，只要是辅养枝影响骨干枝生长时，必须为骨干枝让路。影响轻时，采用去强留弱，适当疏枝，轻度回缩的方法，控制在一定范围内；严重影响骨干枝生长时，则应从基部疏除。
结果枝组的培养
结果枝组是骨干枝和辅养枝上的枝群，经过多年的分枝，转化为年年结果的多年生枝。结果枝组可分为大、中、小3种类型。一般小型枝组具有2~10个分枝，中型枝组有分枝10~30个，大型枝组有分枝30个以上。
花椒由于连续结果能力强，容易形成鸡爪状结果枝群，所以必须注意配置相当数量的大、中型结果枝组。由于各类枝组的生长结果和所占空间的不同，枝组的配置要做到大、中、小相同，交错排列。
由一年生枝培养结果枝组的修剪方法，常用的有以下几种：
1、先截后放法
选中庸枝，第一年进行中度短截，促使分生枝条，第二年全部缓放，或疏除直立枝，保留斜生枝缓放，逐步培养成中、小型枝组。
2、先截后缩法
选用较粗壮的枝条，第一年进行较重短截，促使分生较强壮的分枝，第二年再在适当部位回缩，培养中、小型结果枝组。
3、先放后缩法
花椒中庸枝较弱的枝，缓放后很容易形成具有顶花芽的小分枝，第二年结果后在适当部位回缩，培养成中、小型结果枝组。
4、连截再缩法
多用于大型枝组的培养，第一年进行较重短截，第二年选用不同强弱的枝为延长枝，并加以短截，使其继续延伸，以后再回缩。
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